正史之中称他死后，根据遗训，被埋在汉中的定军山下。连张献忠入川，但是对诸葛亮的墓地也不敢乱动，这其中有三种说法，或许可以解释这个难题。一种说法是诸葛亮在自己的墓地中布置了大量的机关，因为诸葛亮本身就是一个机关大师，这导致无人敢靠近，另一说法则是定军山下的诸葛亮墓是假的。
其实，定军山并不是他的真墓。 原来诸葛亮自五丈原一病不起后，自知寿数已尽，便对后事作了精心安排。他早已料定，蜀汉不久将被魏所亡，自己与司马喜懿交兵多年结有深仇，如果自己的墓地被敌人知晓，尸首肯定不会得到安宁。
诸葛亮在死前认为蜀汉怕是难以支撑下去了，于是留下遗嘱，让四个壮汉抬着自己的棺材下葬，若是到了哪个地方绳子断了，那就是他的葬身之地。
至于第三种说法则是有些神话了，那就是明代朱元璋的首席军师刘伯温觉得自己帮着朱元璋打下了整个天下，而诸葛亮仅仅只是帮着拿下了三分之一天下。
所以自己比诸葛亮更为厉害，但是怎样才能让天下人知道呢？思来想去，刘伯温居然去挖坟，谁知道挖开了诸葛墓地，发现了其中一块石碑上有自己的名字，不禁冷汗直流，磕头跪拜。这第三种说法似乎禁不起推敲，诸葛亮就算再厉害，也不可能预测未来。
这个故事至此就该结束了。但是后人为了渲染诸葛亮之机智，认为这一切都在诸葛亮预料之中，因为孔明早已料到，自己死后蜀国必为司马氏所灭，而蜀国灭亡后司马氏必来挖他的坟墓，所以他“导演”了这出戏剧，以保自己死后的安宁。
奇怪的是后来诸葛亮墓的顶上居然长出了一颗高大的黄果树，依据中国传统文化，是不会在墓的上方种树的，然而却出现了这么一个奇怪的现象。因此后人就展开了联想，认为这是诸葛亮的妻子黄阿丑对丈夫的一片真心，便化身为一棵黄果树，在心爱的丈夫的墓上，为他遮风挡雨，庇护着他。
其实诸葛亮的墓地为何没有被人挖掘，靠的是个人名望，因为在民间，诸葛亮的名头特别响亮，加上他一生简朴，墓中不可能有什么珍贵的陪葬品。所以诸葛亮的墓地至今才保存完整。
